为了应对不同的情况，西红柿需要不同的枝条处理，有些需要留下优质的幼苗，有些则是为了提高质量，所以修剪的方式也不同。以下是一些比较常见的修剪方法。
单杆整枝原则是只留下树干，清理其他枝干，集中所有养分，使树干的果实迅速成熟，每枝只留下几个穗果。如果农民想抓住时间上市，我们可以这样考虑，有些农民为了培育高质量的幼苗也会选择这种方式，因为这样的修剪结果会导致少量的结果，但质量更高，种子的保留质量也比较高。
多穗单干整枝当修剪一些优质的茎来保持，其他弱的枝条要清理时，每个枝条留下更好的发育穗果，其他枝条也被清理掉。主要目的是培育出一波生长得更好的西红柿，减少弱番茄的数量，这样营养物质就能最大限度地提高生产效益。如果你想开始自己的品牌，或者你准备好打一场质量战，你基本上会想到这一点，随后就会有许多温室种植者。
双杆整枝这种修剪与单极修剪的不同之处在于它多留了一根枝条，整个苗只保留了两根枝条，第一枝在快速成熟时，多余的养分不会被浪费，可以提供第二根穗的生长，这通常更适合在肥沃的地方，或者一些高产的品种也是合适的。但是，在修剪时，要注意移除一些老叶子，以免增加养分的消耗。
连续换头整枝其实，这个原则很简单，就是对生长不好的枝条进行修剪，无论是树干还是其他枝条，生长都不容易直接修剪，然后等待后续侧枝生长和观察生长，进行弱干修剪，目的是保持植株的高产、优质，使植物养分得到最大限度的利用，一些追求产量的农民可以这样考虑。
